济宁工商档案扫描数字化系统软件公司有：

1. 山东德林信息：该公司提供档案数字化加工整体解决方案，包括纸质档案数字化、数字化结果高质量、确保档案的真实性、完整性、安全性。
2. 济宁卓越档案管理：该公司提供专业的档案管理咨询、数字化加工、保管寄存、整理装订、销毁等一站式档案服务。

此外，还有山东齐鲁瑞格信息、济宁金农农业科技服务等公司也提供工商档案扫描数字化系统软件服务。建议您根据具体需求选择合适的企业。