巢湖市档案数字化系统软件公司有：

1. 安徽信诚创智科技：主营数字化档案管理系统、档案软件、档案库房密集架等。
2. 安徽合智档案管理服务：提供档案数字化管理、整理、扫描、修复等一站式档案服务。
3. 合肥润坤信息科技：主营数字化档案管理系统、图书管理系统等，提供软件开发及档案数字化加工服务。

此外，巢湖市档案数字化系统软件公司还有巢湖市立信档案管理、合肥市鸿蒙档案服务等。请注意，以上信息可能存在更新或变化，具体情况以公司官网为主。