安徽省纸质档案扫描数字化加工系统软件公司有：

1. 安徽鼎力软通科技：该公司是一家专业的数字化加工服务提供商，提供纸质档案数字化服务、各类文件扫描服务、软件开发服务等。
2. 安徽信创时代数字技术：该公司是一家以拥有自主知识产权的国产操作系统为核心，集研发、生产、销售一体化数字技术企业，主要业务包括数据采集、数字档案、数据治理等。
3. 合肥市创锐信息科技：该公司是一家以数字化服务为核心的公司，服务包括纸质档案数字化加工、图书数字化、文件扫描等。

以上公司都有相应的软件产品，可以提供纸质档案扫描数字化加工系统软件的服务。您可以根据您的需求和预算选择合适的公司。