海口市从事文书档案数字化系统软件的公司有：

* 海口市果实农业科技，其服务范围包括文书档案数字化。
* 海口市龙华海之翼档案管理服务部，其服务包括档案数字化、文书档案整理等。

此外，海口市锐意电子科技、海南思可达信息科技也提供了文书档案数字化服务。

以上可能不包括全部提供文书档案数字化服务的公司，且由于市场变化，具体信息请参考官方渠道获得。