济宁电子档案扫描数字化系统软件公司有：

1. 济宁乐速科技：主要经营电子数据整理、电子档案管理、数据备份等。
2. 济宁天创科技：专注于档案管理软件的研发、销售、咨询、服务，提供档案管理一站式解决方案。
3. 济宁鸿图信息：提供档案管理软件、数字化加工软件、电子文件管理平台、智慧档案云平台等系列产品。

此外，还有山东百思特信息、山东飞天科技、济宁齐鲁档案馆等公司也提供电子档案扫描数字化系统软件的服务。建议根据您的需求和预算选择合适的公司。