人事档案系统管理指的是对员工的个人信息、工作记录和相关文件进行管理、维护和保密。这一系统通常由人力资源部门负责管理，以确保公司遵守法律法规，并有效地管理员工信息。

人事档案系统管理包括以下几个方面：

1. 建立与维护员工档案：包括个人基本信息、合同、培训记录、绩效评估、工作经历等。这需要建立一个完善的档案管理流程，确保信息准确无误。

2. 保密与安全：人力资源部门需要确保员工档案的保密性，只有授权人员才可以访问敏感信息。同时，还需要采取措施确保档案的安全，如数据加密、访问权限管控等。

3. 法律合规：确保员工档案的管理符合当地的劳动法、隐私法和其他相关法规，以避免违规操作所带来的风险。

4. 档案整理与归档：定期清理、整理档案，并按照法定要求进行归档，以便在需要时进行查阅。

综上所述，人事档案系统管理是人力资源管理中至关重要的一环，它涉及到员工信息的合规管理、保密性和安全性，对于公司和员工都具有重要意义。