滁州档案数字化系统软件公司有：

1. 安徽金松软件科技：主营档案管理软件、数字化加工扫描设备、数字化软硬件产品。
2. 安徽百胜软件：提供档案管理软件、数字化加工服务。
3. 安徽中新信息科技：提供数字化加工、档案管理软件、电子病历系统、智慧医疗系统等解决方案。
4. 安徽三联软件股份：主营文件图纸档案管理软件、数字化加工扫描。
5. 安徽联宇信息：提供数字化加工、档案软件等一体化服务。
6. 安徽新图数字科技：主营数字档案软件、数字化加工服务。

以上公司都有档案数字化系统软件的相关服务，建议根据具体需求选择。