淮南纸质档案扫描数字化系统软件公司有：

1. 安徽云龙信息科技：该公司是一家专业从事数字化档案管理服务的公司，拥有先进的档案管理软硬件设备和专业的技术团队。
2. 淮南市壹通信息技术：该公司是一家专业从事数字化档案建设、软件开发、信息系统集成等服务的公司，拥有多项行业资质和专业设备。

此外，还有淮南市恒瑞信息科技等公司也提供纸质档案扫描数字化系统软件。以上公司仅供参考，如需了解更多信息，请咨询淮南当地专业人士。