淮南档案数字化系统软件公司有：

1. 淮南市金点档案数字化技术服务：主营档案数字化、档案整理、档案扫描、档案录入等档案数字化服务。
2. 淮南市档案局：负责全市的档案业务指导、监督和协调工作，同时也提供档案整理、数字化服务。
3. 淮南市鑫诚档案数字化服务：提供档案整理、档案数字化服务，以及档案整理咨询、档案数字化软件销售等服务。
4. 淮南市华图信息咨询：提供档案管理软件销售及售后服务，包括档案数字化、档案整理、档案借阅管理等服务。
5. 淮南市金典档案管理服务：专业从事各类档案整理、档案数字化、档案管理软件开发等业务。
6. 安徽信诚信息咨询：提供档案整理、档案数字化、档案管理软件等服务。
7. 淮南市锐信信息咨询：主营档案整理、档案数字化及软件开发等业务。

以上公司都是淮南市内提供档案数字化系统软件的公司，具体选择哪一家公司，需要结合实际需求和预算等进行考虑。