淮南档案扫描数字化加工系统软件公司有：

1. 安徽云龙信息科技：该公司专注于数字化加工管理系统软件研发、推广，并致力于为客户提供数字化加工整体解决方案。
2. 安徽联文信息科技：该公司是一家集软件开发、系统集成、数据服务等于一身的信息科技公司。

此外，还有淮南市金点子档案管理、淮南市红枫叶图文信息等公司也提供档案扫描数字化加工服务。

以上公司均有可能成为淮南档案扫描数字化加工系统软件公司，建议根据具体情况进行选择。