淮南工程档案扫描数字化系统软件公司有：

1. 安徽金莱达电子科技：这家公司专业从事于数字化处理、档案信息化、智能化信息化建设，提供工程档案扫描数字化系统软件。
2. 安徽百胜软件：这家公司是一家从事档案信息化行业的公司，提供工程档案数字化处理业务，同时提供档案数字化系统软件。

除了以上两家公司，淮南工程档案扫描数字化系统软件公司还有可能包括其他一些信息处理技术公司等。如需获取更详细的信息，建议您进一步咨询淮南当地的信息化建设公司。