海口行政档案扫描数字化系统软件公司有：

1. 海南云脉技术：该公司是一家专注于档案数字化管理领域的信息化技术公司，提供包括档案数字化加工、档案管理软件、档案数字化设备及相关耗材的销售和租赁等业务。
2. 联想佳诚：该公司是专业从事档案信息化管理系统的研发、生产和销售的高新技术企业，其数字化平台产品包括联想佳城数字档案管理系统、海纳档案管理系统、电子档案文件库等。
3. 华天诚业：该公司的档案管理软件在海口地区拥有较高的市场占有率，其软件功能涵盖档案整理、数字化加工、档案管理等各个领域。

以上公司都是海口地区在档案数字化领域具有一定实力和影响力的企业，您可以根据实际需求和预算选择合适的公司。