海口科技档案数字化系统软件公司有：

1. 海南海图软件：该公司主要提供档案管理软件，包括档案数字化服务、数字化升级、软件销售等。
2. 海南数讯科技股份：该公司提供档案管理系统，包括数字化加工软件、档案整理软件、档案库房管理系统等。
3. 海南威盾科技：该公司专注于建筑行业数字化解决方案，包括档案数字化加工、软件开发、系统集成等。

以上公司都有一定的技术实力，可以开发档案数字化系统软件。请注意，选择软件公司时，除了考虑技术实力，还要考虑公司的服务质量、售后支持等因素。