海口档案扫描数字化加工系统软件的公司有：

1. 海南信脉档案数据管理：该公司专业从事数字化加工服务，拥有一支专业、稳定的团队，为客户提供高效、优质的档案数字化加工服务。
2. 海南海声档案管理：该公司以提供专业档案整理、档案数字化等服务为主。
3. 海口市韬奋档案管理：这是一家以提供档案管理咨询、档案整理、档案数字化服务为主的机构。

以上公司都有相应的系统软件可以用于海口档案扫描数字化加工，建议根据具体需求选择合适的服务提供商。