济宁档案数字化加工系统软件公司有：

1. 山东云腾科技。
2. 山东海创档案管理。
3. 山东金城档案管理。
4. 山东超讯科技。
5. 山东鑫莱源信息科技。
6. 济宁智软科技。
7. 济宁网之翼信息科技。

以上这些公司都提供档案数字化加工系统软件，你可以根据他们的服务范围、用户评价、公司规模等因素，选择适合你的公司。