提供济宁合同档案扫描数字化系统软件的公司有：

1. 浪潮卓越电子文档公司：这是一家专业的档案数字化服务公司，可以提供合同档案的扫描、编目、数字化管理等服务。
2. 世纪纵横信息科技公司：该公司也提供专业的文档数字化服务，包括合同档案的扫描、处理、存储等服务。

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