常州市从事扫描数字化档案扫描系统软件公司的公司有：

1. 常州数码利科技：他们开发出了一款适用于各机关、企事业单位文件档案电子化管理解决方案，方案涵盖扫描数字化档案扫描系统软件、数字化文件档案管理库、档案管理精英人才培训等。
2. 常州瀚存科技：该公司是一家专门从事数据采集、数据整理、数字化加工、数据安全管理等一体化服务的企业，他们也有数字化档案管理系统软件。

以上公司具体信息建议查询公司官网或询问常州市当地人士获取。