巢湖行政档案扫描数字化系统软件公司有：

1. 安徽速豹档案数字化。
2. 合肥市金易信息科技。
3. 安徽鑫松科技发展。

此外，还有巢湖市云燕数字化技术服务部也提供行政档案扫描数字化系统软件服务。建议根据实际需求选择合适的公司进行合作。