巢湖市档案数字化系统软件公司有：

1. 安徽金点档案数字化技术服务。
2. 合肥市金巢档案技术服务。
3. 巢湖市数字档案馆服务部。
4. 安徽金松数字档案成套技术。
5. 安徽金智档案管理服务。

以上公司均提供档案数字化服务，您可以根据您的需求，选择合适的公司进行咨询和合作。