宝鸡纸质档案扫描数字化系统软件公司有：

1. 宝鸡市惠诚数字科技：该公司专业从事纸质档案数字化加工，提供宝鸡纸质档案扫描、整理、数字化加工一站式服务。
2. 陕西金图文档影像：该公司是一家集文件数据化处理（纸质文档扫描、照片档案扫描、纸质档案扫描等）、电子档案管理系统建设、数据备份恢复、云存储服务为一体的高新技术企业。
3. 宝鸡市金石档案数字化加工：该公司从事各种纸质档案、资料、票据整理、分类、数字化扫描加工等业务。
4. 秦诚数据科技：该公司是一家专业从事宝鸡地区纸质档案数字化加工的公司，提供档案整理、数字化加工、档案管理等服务。

以上公司均可以提供纸质档案扫描数字化系统软件服务，建议根据自身需求选择合适的企业。