1. 数据安全问题：数字化档案需要妥善保护，防止数据泄露、损坏和丢失。

2. 文件格式不统一：数字化档案文件格式不同，导致难以共享和整合。

3. 元数据不足或不准确：元数据是指记录档案信息的数据，如果不足或不准确，会影响数字化档案的利用价值。

4. 扫描质量问题：扫描过程中可能出现图像模糊、色彩失真、缺页等问题，影响档案质量。

5. 版权问题：数字化档案中可能存在版权问题，需要遵循相关法律法规进行处理。

6. 数字化技术更新换代快：随着数字化技术的发展，新的数字化技术不断涌现，旧的数字化档案可能会面临无法打开等问题。