档案扫描的计费方式主要有以下几种：

1. 按纸张数量计费：按照扫描的纸张数量进行计费，一般按照每张纸收取一定的费用，可根据纸张大小和颜色深浅等因素进行不同的定价。

2. 按工作量计费：按照扫描工作的难易程度和时间长短进行计费，一般根据文件的复杂程度、扫描质量和排版要求等因素来确定价格。

3. 综合计费：综合采用以上两种计费方式，结合具体情况进行价格制定。

另外，还需考虑是否需要后期处理、文件转换、加密等服务，这些也可能会影响价格。