最好的扫描档案仪器因应用场景和需求不同而异，以下是几种常见的扫描档案仪器：

1. 扫描仪：可以将纸质文件转换为电子文档，适用于扫描单面或双面文档。
2. 文书扫描仪：可以处理较大尺寸的文件、卷轴、图纸等特殊文档。
3. （高速）自动文档喂纸扫描仪：适用于批量、快速地扫描多页文档或合并成PDF格式，可有效提高工作效率。
4. 光学字符识别（OCR）设备：能够将扫描得到的文档进行文字识别和编辑，方便后期增删改查，提高文档利用率。

因此，选择最好的扫描档案仪器需要根据实际需求和预算来综合考虑。