滁州纸质档案扫描数字化系统软件可以使用飞猫传书等工具。这些工具可以提供纸质档案扫描数字化服务，将纸质文档转化为数字格式，并能够进行文件分类、整理、打包等操作，以方便档案的存储和管理。

此外，还有一些专门针对档案数字化的软件，如档案扫描软件、数字化档案管理软件、档案管理系统等，这些软件可以提供多种功能，如扫描、识别、保存、查询、分享等，方便使用者进行档案的管理和利用。

在进行数字化时，需要确保扫描的清晰度较高，以便于后续的查阅和使用。同时，需要将档案按照一定的顺序编号，并在数字化后的文件中保持相同的编号顺序，以便于后续的分类、整理和查找。