淮南行政档案数字化系统软件公司有：

1. 安徽九华山恒企软件：主营会计、税务、审计、人力资源、管理软件，并提供企业定制软件服务。
2. 淮南市美亚信息科技：提供档案数字化加工服务，同时销售数字化设备。
3. 安徽科诺信档案管理：提供档案管理软件、数字化加工服务。

此外，淮南市冠林信息科技、淮南市鑫创联科技、淮南市创联信息科技等也提供档案数字化系统软件服务。请注意，以上公司名称仅供参考，您可以通过查询公司官方网站或咨询淮南地区相关机构获取准确信息。