淮南市从事档案扫描数字化系统软件开发的公司有：

1. 淮南市金锐档案管理，该公司专业从事档案数字化处理，拥有专业的档案数字化设备，提供上门装订、整理、扫描服务，可快速完成档案的整理和数字化工作。
2. 淮南市锐速信息科技，该公司经营范围包括软件开发等，也许能够提供淮南工商档案扫描数字化系统软件。

以上信息仅供参考，如果你需要更具体更准确的信息，建议你查找相关行业报告或联系淮南市工商局、档案局等部门获取。