海口科技档案扫描数字化系统软件公司有：

1. 海南中航信信息技术：该公司是是中国航空航天工业规划设计研究院在海南的分院，主要从事档案数字化建设工作。
2. 海南龙信达科技：该公司是专业从事数字化加工、软件研发、系统集成、文档数字化管理、软件开发、产品销售为一体的高科技企业。
3. 海南四通科技：该公司主要业务范围包括数字化加工、电子文件中心、软件开发和数字资源管理服务、信息技术外包。

希望以上信息可以帮到你。具体选择哪家公司还需要根据具体情况判断。