济宁市档案扫描数字化系统软件公司有：

1. 山东润鑫档案科技：主营数字化档案建设、档案软件开发、档案用品销售等。
2. 济宁金鑫档案数字化：提供档案数字化加工、档案软件开发、网络布线、监控安装等服务。
3. 山东鲁邦信息科技：提供档案数字化管理、数字化加工、软件开发等业务。
4. 济宁鸿泰金点子信息技术：提供数字化加工、电子病历开发、医院档案管理软件等服务。
5. 济宁阳光浩文书：从事档案数字化、凭证存放证明开具、技术咨询等服务。

以上公司都有一定的实力和经验，可以提供档案数字化系统软件的服务。