济宁工程档案扫描数字化系统软件公司有：

1. 山东远志软件：专业从事档案软件研发、数字化档案建设、档案咨询服务的科技企业。
2. 济宁诚信档案管理咨询：专业从事济宁工程档案整理、数字化加工、档案整理、档案数字化建设等业务。
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