济宁会计档案扫描数字化系统软件公司有：

1. 山东金石兴信息科技。
2. 山东中天世纪信息咨询。
3. 山东金算盘软件。
4. 山东赛石信息科技。

以上公司都在济宁从事会计档案扫描数字化系统软件的开发和销售，希望这些信息对你有所帮助。请注意，选择合适的软件公司应考虑更多因素，如服务、价格、公司背景等。