桂林市档案数字化系统软件公司有：

1. 广西仕桂网络科技：该公司主要提供数字化档案软件开发、定制档案数字化设备、档案管理软件系统集成等服务。
2. 桂林海创置业：其开发的项目包括桂林市档案数字化及信息化管理工程项目等。

此外，还有桂林电子科技、桂林数独城网络科技等也在提供档案数字化服务。建议根据需求选择合适的企业。