晋中市从事纸质档案扫描数字化系统软件的公司有：

1. 山西数独科技，主营产品包括纸质档案扫描数字化系统。
2. 山西速图信息技术，是一家专业提供档案管理数字化服务的公司，其纸质档案扫描数字化系统可以很好地保护档案原件，降低档案损毁风险，提高档案储存空间，并且方便快捷的满足各企事业单位的档案管理需求。

此外，晋中市致远数字化科技、山西创客之家科技、山西图灵数字科技、山西微智达信息科技等公司也提供纸质档案扫描数字化系统服务。以上公司均在晋中市从事该项业务，您可以根据您的需求，选择适合您的公司进行咨询。