巢湖基建档案数字化系统软件公司有：

1. 安徽筑友信息技术：主营数字档案管理系统、智慧工地等产品，拥有完整的软件研发、测试及生产能力。
2. 合肥赛腾信息科技：专业从事建筑智能化信息系统建设，包括数字档案系统等。
3. 安徽筑讯信息科技：拥有自主知识产权的建筑档案数字化系统。

此外，还有合肥工为科技、合肥德力信息科技等公司也提供基建档案数字化系统软件服务。

以上公司均在巢湖地区设有分支机构或服务范围包含巢湖地区，是当地基建档案数字化系统软件公司的良好选择。