宝鸡行政档案数字化系统软件公司有：

1. 陕西金叶科教集团股份：该公司有多家分支机构，包括信息技术中心，可提供档案数字化服务。
2. 宝鸡信雅达信息服务：该公司可提供档案管理软件和数字化服务。
3. 陕西同兴科技开发：该公司是一家科技型企业，可提供数字化档案管理软硬件产品及服务。

建议根据实际需要选择合适的公司进行咨询。