南京市档案信息化系统是指整个南京市档案馆和相关机构采用信息技术手段对档案管理进行全面的数字化、电子化管理的系统。一般来说，这样的系统通常包括档案数字化、电子文件管理、档案检索、档案保管、档案查询等功能。

南京市档案信息化系统的建设意味着档案管理由传统的手工纸质管理逐步转向电子管理，可以带来诸多益处，包括方便快捷的档案查询与检索、更好的档案保护与安全、提升工作效率等。同时，这也需要高度的信息安全保障，以确保档案信息不被非法获取或篡改。

在系统建设过程中，南京市档案馆可能会利用先进的数字化设备，制定档案信息化管理规范，培训相关工作人员等，以确保系统的顺利推进和有效运行。需特别留意隐私数据保护以及信息存储的持久性，从长远角度确保档案信息的安全性和可持续性。